Adını, kenarında bulunduğu gölden alan Köyceğiz'in ilçe merkezi bir ara Dalyan köyü olmuş, ancak su baskınları nedeniyle Muğla ile bağlantısının kesilmesi sonucu bugünkü yerine taşınmıştır.Karyalı'lar ve Menteşoğullarına yurt olmuş, 2. Murat zamanında sancak haline getirilmiştir. Cumhuriyetimizin kurulması ile birlikte Muğla iline bağlı ilçe olmuştur.